肺癌49基因检测
利用高通量测序平台,一次性检测肺癌靶向药物相关49个基因的多种变异类型,同步解析敏感突变与耐药突变,提示40余种靶向药物的用药信息,综合指导肺癌患者的个性化用药。
检测方案
基因列表 | 常见变异位点 | 可获益靶向药物 |
EGFR | p.L858R,p.L861Q,p.T790M,p.C797S,c.exon 19 deletions,c.exon 20 insertions,EGFR 扩增 | 吉非替尼/厄洛替尼/阿法替尼/埃克替尼/达克替尼/奥希替尼/阿美替尼/伏美替尼/帕尼单抗/西妥昔单抗/尼妥珠单抗/Amivantamab/Mobocertinib |
HER2 | c.exon 20 insertions, p.D769Y, p.L755_T759del, p.D769H | 拉帕替尼/曲妥珠单抗/帕妥珠单抗/来那替尼/吡咯替尼/T-DM1/DS-8201 |
MET | MET扩增,c.exon 14 skipping | 克唑替尼/卡博替尼/卡马替尼/Tepotinib/沃利替尼 |
KRAS | p.G12D,p.G12V,p.G12C,p.G13D | 曲美替尼/司美替尼/Sotorasib/Abemaciclib |
BRAF | p.G12D,p.G12V,p.G12C,p.G13D | 维罗非尼/曲美替尼/(达拉非尼+曲美替尼) |
ALK | EML4—ALK,p.G1269A, p.1151Tins,p.l1171N/S | 阿来替尼(艾乐替尼)/克唑替尼/色瑞替尼/Brigatinib/劳拉替尼/恩沙替尼 |
ROS1 | CD74-ROS1,SDC4-ROS1 | 克唑替尼/色瑞替尼/劳拉替尼/恩曲替尼 |
RET | CCDC6-RET,KIF5B-RET,HOOK1-RET | 普拉提尼/Selpercatinib/凡德他尼/卡博替尼/舒尼替尼/索拉非尼/瑞戈非尼 |
NTRK1/2/3 | LMNA-NTRK1,STRN-NTRK2,ETV6-NTRK3 | 拉罗替尼/克唑替尼/恩曲替尼/LOXO-195 |
其他潜在获益基因:ABL1、AR、ATM、BARD1、BRIP1、CDH1、CTNNA1、DPYD、ERCC1、EZH2、FANCL、FGFR1/2/3、GSTP1、KDR、KIT、KMT2A、MAP2K4、MTHFR、MTR、NF1、NRAS、PALB2、PDGFRA/B、PIK3CA、PPP2R2A、PTEN、SOD2、STK11、TP53、TPMT、TSC1/2、UMPS、XPC、XRCC1 | ||
FDA/NMPA/EMA获批药物 在研药物 | 注:本次检测包含但不限于以上常见突变位点 | |
检测周期
组织样本:6个自然日;血液样本:5个自然日。
适用人群
初诊初治的非小细胞肺癌患者。
有靶向药物用药需求的非小细胞肺癌患者。
样本类型
手术/穿刺组织石蜡贴片、手术/穿刺新鲜组织、石蜡包埋组织、外周血。
下附常见基因含义:
1.EGFR(表皮生长因子受体),约10%的非小细胞肺癌患者中,EGFR基因会发生异常或突变。EGFR突变可能影响肿瘤对特定药物的敏感性。(可参肺癌11基因检测)
2.HER2,也被称为人表皮生长因子受体2(Human Epidermal Growth Factor Receptor 2),或者缩写为CD340(cluster of differentiation 340。这个基因编码的蛋白质通常位于细胞膜中。与ERBB家族的其他成员不同,HER2并不直接与配体结合。HER2的激活是通过与其他ERBB成员异二聚化,或者当HER2浓度很高时通过同二聚化来实现的。HER2之所以得名,是因为其结构与人类表皮生长因子受体1(HER1)相似。
3.KRAS(Kirsten rat sarcoma virus)基因,其全称为K-Ras,它是RAS/MAPK通路的一部分。
- 功能:
- KRAS基因编码一种叫做K-Ras的蛋白质,它在细胞外部信号传导到细胞核的过程中起着关键作用。
- 这些信号指导细胞进行生长和分裂(增殖),或者成熟并具有特定功能(分化)。
- K-Ras蛋白质是一种GTP酶,它将一种叫做GTP的分子转化为另一种叫做GDP的分子。这使得K-Ras蛋白质就像一个开关,由GTP和GDP分子的结合来打开和关闭。
- 为了传递信号,它必须通过与GTP分子结合来打开。当蛋白质与GDP结合时,它不会将信号传递到细胞核。
- 癌症中的作用:
- KRAS基因属于一类被称为致癌基因的基因。当发生突变时,这些基因有潜力使正常细胞变成癌细胞。
- KRAS基因位于Ras家族的致癌基因中,其中还包括另外两个基因:HRAS和NRAS。这些蛋白质在细胞分裂、分化和自我毁灭(凋亡)中起着重要作用。
- 功能:
4.BRAF(B-Raf Proto-Oncogene)基因,编码一种名为B-Raf的蛋白质。这个基因也被称为原癌基因B-Raf和v-Raf小鼠肉瘤病毒致癌基因同源体B,而蛋白质的正式名称是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-Raf。B-Raf蛋白质在细胞内部传递信号中起着重要作用,这些信号涉及到细胞生长的方向。在2002年,研究发现它在某些人类癌症中发生了突变。B-Raf是Raf激酶家族中的一员,属于生长信号传导蛋白激酶。该蛋白质在调节影响细胞分裂、分化和分泌的MAP激酶/ERK信号通路中发挥作用。
5.ALK(Anaplastic Lymphoma Kinase)基因,编码一种名为ALK受体酪氨酸激酶的蛋白质。功能:
- ALK基因提供了制造ALK受体酪氨酸激酶的指令,它是一类蛋白质中的一员,称为受体酪氨酸激酶(RTKs)。
- 受体酪氨酸激酶通过一种称为信号转导的过程,将信号从细胞表面传递到细胞内部。
- 这个过程开始于细胞表面的激酶被刺激,然后与类似的激酶结合(异二聚化)。异二聚化后,激酶被标记为磷酸基团(一簇氧和磷原子),这个过程称为磷酸化。磷酸化会激活激酶。
- 激活的激酶能够将磷酸基团转移给细胞内的另一个蛋白质,从而激活该蛋白质。这个激活过程通过一系列蛋白质在信号通路中继续进行。这些信号通路在许多细胞过程中非常重要,例如细胞生长和分裂(增殖)或成熟(分化)。
- 与神经细胞增殖的关系:
- 尽管ALK受体酪氨酸激酶的具体功能尚不清楚,但它被认为在发育的早期阶段起着调节神经细胞增殖的作用。
- ALK基因的突变与某些癌症有关,但它在正常发育中的作用仍在研究中。
6.ROS1(ROS Proto-Oncogene 1, Receptor Tyrosine Kinase)基因,编码一种名为ROS受体酪氨酸激酶的蛋白质。
功能:
- ROS1基因编码的蛋白质属于七不同亚家族的酪氨酸激酶胰岛素受体基因。
- 这个蛋白质是一种I型跨膜蛋白,具有酪氨酸激酶活性。
- 它可能作为生长或分化因子受体发挥作用。
- 在癌症中的作用:
- ROS1是一种受体酪氨酸激酶,其结构与**间变性淋巴瘤激酶(ALK)蛋白相似。
- 它是由c-ros癌基因编码的,于1986年首次被发现。
- 在某些肺腺癌中,ROS1呈阳性表达。
- 正常发育中的作用:
- 尽管ROS1蛋白质在正常发育中的确切作用和其生理配体尚未明确,但它在肿瘤细胞中的高表达表明其在癌症中具有重要作用。
7.RET(rearranged during transfection proto-oncogene)基因,编码一种名为RET受体酪氨酸激酶的蛋白质.
- 功能:
- RET基因提供了制造RET受体酪氨酸激酶的指令,它是一类蛋白质中的一员,称为受体酪氨酸激酶(RTKs)。
- 这个蛋白质是一种I型跨膜蛋白,具有酪氨酸激酶活性。
- 它在细胞内部传递信号中起着关键作用,参与多种细胞生长、分化和分泌的过程。
- 与神经细胞和肾脏发育的关系:
- RET蛋白质在正常发育中的作用非常重要。
- 它参与了多种神经细胞的正常发育,包括肠道中的神经元(肠道神经元)和控制心率等自主体功能的神经系统部分(自主神经系统)。
- 此外,RET蛋白质对于正常肾脏发育和精子的产生(精子生成)也是必需的。
- RET蛋白质横跨细胞膜,一端位于细胞内,另一端从细胞的外表面伸出。这种定位使其能够与细胞外特定因子相互作用,并接收帮助细胞应对环境的信号。
8.NTRK1,NTRK2和NTRK3分别是三个与神经生长因子受体相关的基因。
NTRK1(Neurotrophic Receptor Tyrosine Kinase 1):
- 全称:神经营养因子受体酪氨酸激酶1
- 功能:参与神经细胞的发育和分化,以及感觉神经元亚型的特定规定。
- 与疾病的关联:突变与先天性无痛、无汗、自残行为、认知障碍和癌症有关。
- NTRK2(Neurotrophic Receptor Tyrosine Kinase 2):
- 全称:神经营养因子受体酪氨酸激酶2
- 功能:在神经系统的发育和成熟中发挥作用。
- 与疾病的关联:与神经系统疾病和癌症有关。
- NTRK3(Neurotrophic Receptor Tyrosine Kinase 3):
- 全称:神经营养因子受体酪氨酸激酶3
- 功能:在神经细胞的发育和功能中起着关键作用。
- 与疾病的关联:与神经系统疾病和癌症有关。
- ABL1:编码一种酪氨酸激酶,与慢性髓性白血病等癌症有关。
- AR:编码雄激素受体,与雄激素相关的癌症有关。
- ATM:编码一个蛋白质,与DNA损伤修复和癌症敏感性有关。
- BARD1:与BRCA1一起参与DNA修复,与乳腺癌等有关。
- BRIP1:与BRCA1一起参与DNA修复,与卵巢癌等有关。
- CDH1:编码一种细胞粘附蛋白,与乳腺癌和胃癌有关。
- CTNNA1:编码一种细胞粘附蛋白,与多种癌症有关。
- DPYD:与药物代谢和毒性有关。
- ERCC1:与核苷酸修复和癌症敏感性有关。
- EZH2:编码一个表观遗传学调节因子,与多种癌症有关。
- KMT2A:编码一个表观遗传学调节因子,与急性白血病有关。
- FANCL:编码一个蛋白质,与DNA修复和细胞周期调控有关。
- FGFR1/2/3:编码成纤维细胞生长因子受体,与多种癌症和发育异常有关。
- GSTP1:编码谷胱甘肽S-转移酶,参与解毒和抗氧化反应。
- KDR:编码一种叫做VEGFR2的蛋白质,与血管生成和肿瘤血管形成有关。
- KIT:编码一种叫做c-Kit的蛋白质,与多种肿瘤和血液系统疾病有关。
- MAP2K4:编码一种蛋白质,与细胞信号传导和癌症有关。
- MTHFR:编码甲基四氢叶酸还原酶,与代谢和心血管疾病有关。
- MTR:编码甲硫氨酸同型酶,与同型半胱氨酸代谢有关。
- NF1:编码神经纤维瘤病1蛋白,与神经纤维瘤等有关。
- NRAS:编码NRAS蛋白,与多种癌症有关。
- PALB2:与BRCA1和BRCA2一起参与DNA修复,与乳腺癌等有关。
- PDGFRA/B:编码PDGF受体,与肿瘤生长和血管生成有关。
- PIK3CA:编码PI3K蛋白,与细胞信号传导和癌症有关。
- PTEN:编码PTEN蛋白,与细胞增殖和癌症有关。
- TP53:编码p53蛋白,被称为“癌症的守护者”,与细胞周期和DNA修复有关。
- TPMT(Thiopurine S-methyltransferase):编码一种酶,参与代谢抑制免疫系统的药物,如6-巯基鸟嘌呤、6-巯基嘌呤和硫醇嘌呤。这些药物用于治疗多种癌症和免疫系统失调的疾病,如克罗恩病和类风湿性关节炎。
- TSC1/2(Tuberous Sclerosis Complex 1/2):这两个基因编码的蛋白质组成了一个复合体,参与神经切除症复杂的病理生理。该疾病导致大脑、皮肤和肾脏等多个器官中出现错构瘤和其他良性肿瘤。此外,神经系统表现包括自闭症、智力障碍和癫痫。
- UMPS(Uridine Monophosphate Synthetase):编码一种酶,参与DNA单链断裂的高效修复。这些断裂通常由电离辐射和烷基化剂引起。
- XPC(X-ray Repair Cross-Complementing Protein 1):参与识别DNA中的大体积加合物,如紫外线诱导的光产物和环境致突变剂。它是全基因组核苷酸切除修复的初始损伤识别因子。
- XRCC1(X-ray Repair Cross-Complementing Protein 1):参与DNA单链断裂的修复,与离子辐射和烷基化剂暴露有关。
